太平天国起义者们想要建立一个以”天王“为首的农民政权。但是，在以小农业和家庭手工业相结合的分散的小生产的基础上，虽然可以建立暂时的劳动者的政权，但他最终还是会向封建专制政权演变的。
在太平军取得重大胜利的同时，太平天国内部潜在的矛盾和弱点也日益明显的暴露出来了。太平天国领导集团的思想在蜕化，一些人在生活上追求享乐，在政治上争权夺利。太平天国诸王在建都后不久就大兴土木，建立豪华府邸。天王洪秀全“为繁华迷惑，养尊处优，专务于声色货利”，东王杨秀清“自持功高，一切专擅”;诸王与部将及广大士兵关系逐渐疏离，诸王之间更是“彼此猜忌，猜忌日升。“
1856年九月，发生了天平天国内部自相残杀的天京事变。东王杨秀清，北王韦昌辉先后被杀，翼王石达开率部出走败亡。天京事变严重的削弱了太平天国的领导和军事力量，成为天平天国由盛转衰的分水岭。为重整纲纪，挽救危局，洪秀全提拔了陈玉成李秀成等一批具有军事才干的青年军事将领，1859年又封洪仁轩为干王，总理朝政。但是这已经无法从根本上挽回败局。洪秀全本人的保守和迷信思想也越来越严重。当天京被湘军包围时，他拒绝了李秀成提出的”让城别走“另辟新根据地的建议，坚持死守天京。1864年六月，洪秀全病故。7月，天京被湘军攻破。天平天国起义失败。
太平天国农民战争动摇了清王朝封建统治的基础，有力地打击了西方资本主义侵略者，显示了农民阶级的反抗精神和战斗力力量。然而，农民阶级不是新的生产力和生产关系的代表，他们无法克服小生产者所固有的阶级局限性，因而无法从根本上提出完整的正确的政治纲领和社会改革方案，无法制止和克服领导集团自身腐败现象的滋长，也无法长期保持领导集团的团结。这一切都大大地削弱了太平天国的向心力和战斗力。太平天国是以宗教来发动组织群众的，但是，拜上帝教教义毕竟不是科学的思想理论，它不仅不能正确的指导斗争，而且给农民战争带来了危害。在太平天国后期，洪秀全甚至认为”天生真命主，不用兵而定太平一统，“梦想以虚幻的力量代替农民，农民起义者自身的努力。
太平天国也未能正确的对待儒学。开始时，他们把儒家经书笼统地斥之为”妖术“。后来，他们对儒学的态度有所变化，主张将”四书““五经”删改后加以利用。不过删去的主要是与太平天国宗教不相容的内容，而把儒学中的封建纲常伦理原则原封不动地保留了下来。太平天国的领袖们不承认不平等条约，这是很正确的。但他们不能把西方侵略者和人民群众区别开来，而是笼统地把信奉天父上帝的西方人都视为”杨兄弟"，这说明他们对于西方资本主义侵略者还缺乏理性地认识。
太平天国起义及其失败表明，在半殖民地半封建的中国，农民具有伟大地革命潜力，但它自身不能担负起领导反帝反封建斗争取得胜利的重任。单纯地农民不可能完成争取民族独立和人民解放的历史人物